Etude du chemin reactionnel du ribozyme de l'hepatite D humaine

Du fait de la complexite du repliement de l'ARN en general et des mecanismes impliques dans ce processus, il est actuellement impossible de predire la structure tridimensionnelle et encore moins le chemin reactionnel d'un ARN en se basant uniquement sur sa sequence primaire. Ces deux questions fondamentales doivent etre adressees pour comprendre ce qui se passe dans une cellule et pouvoir un jour etre capable de creer de novo des molecules d'ARN avec une structure et une activite precise.;Mots cles: Ribozyme HDV; Repliement de l'ARN; Chemin reactionnel; Thermodynamique; Structure de l'ARN.;L'objectif de ce travail est de mieux comprendre les forces permettant d'obtenir une structure tridimensionnelle et les mecanismes impliques dans le chemin reactionnel d'un ARN modele hautement structure: le ribozyme de l'hepatite D humaine (ribozyme HDV). L'idee est que s'il est possible de comprendre dans les moindres details une structure complexe, ces informations pourront etre utilisees pour la prediction de structures plus simples. Premierement, il s'agit de trouver quels sont les changements conformationnels du chemin reactionnel et dans quel ordre ils ont lieu. Une fois le chemin reactionnel connu, il devient possible de generer des mutants formant des intermediaires stables entre chaque changement conformationnel. L'etude thermodynamique de ces mutants permet de dresser le profil energetique du chemin reactionnel. Finalement, la modelisation permet de suivre l'evolution de la structure tertiaire et ainsi verifier differentes hypotheses. Ensemble, ces approches ont permis de comprendre comment le ribozyme HDV atteint sa structure tridimensionnelle, quel chemin reactionnel il emprunte et quelle est l'etape limitante.