Caracterisation et comparaison de plasmides se repliquant en mode theta chez Streptococcus thermophilus

Streptococcus thermophilus est une bacterie lactique a Gram-positif largement utilisee pour la transformation du lait en fromage et en yogourt. Depuis quelques annees, les plasmides de cette espece bacterienne font l'objet d'etudes approfondies. Aujourd'hui, 21 sequences nucleotidiques completes de plasmides de S. thermophilus sont disponibles. La majorite des plasmides de cette espece se repliquent selon un mode en cercle roulant (CR). Avant cette etude, pSMQ-308 etait le seul plasmide de S. thermophilus a replication de type theta (theta) dont la sequence nucleotidique complete etait connue. Dans cette etude, la sequence nucleotidique a ete determinee pour deux autres plasmides de S. thermophilus, pSMQ-312b et pSMQ-316, classes dans le meme groupe d'homologie d'ADN que pSMQ-308. La sequence nucleotidique de l'ADN de ces deux plasmides s'est averee identique malgre le fait que ces plasmides aient ete isoles de deux souches bacteriennes differentes. Des analyses bioinformatiques comparatives ont egalement revele un haut degre d'identite entre la sequence de pSMQ-308 et celle des deux autres plasmides. Des essais de stabilite ont montre que pSMQ-312b et 316 sont plus stables que pSMQ-308. Des tentatives d'isolement du replicon minimal de pSMQ-312b ont donc ete privilegiees compte tenu de sa stabilite et de sa plus petite taille (6,7 kb). L'avancement des connaissances sur les plasmides theta de S. thermophilus permettront le developpement de nouveaux outils genetiques.